Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP2Q06481 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APLP2Q06481 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms