Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms