Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms