Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms