Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms