Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms