Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF9Q00978 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms