Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSG4Q00888 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSG4Q00888 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms