Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms