Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAE1P78406 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAE1P78406 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAE1P78406 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAE1P78406 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms