Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX1P78337 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX1P78337 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX1P78337 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX1P78337 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX1P78337 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX1P78337 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX1P78337 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX1P78337 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX1P78337 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX1P78337 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX1P78337 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX1P78337 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms