Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL23P62829 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL23P62829 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL23P62829 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL23P62829 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL23P62829 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL23P62829 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL23P62829 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL23P62829 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL23P62829 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms