Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO4P61968 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms