Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms