Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX10P56693 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX10P56693 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX10P56693 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX10P56693 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX10P56693 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX10P56693 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX10P56693 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms