Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP7P55210 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP7P55210 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP7P55210 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP7P55210 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP7P55210 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP7P55210 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP7P55210 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP7P55210 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP7P55210 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP7P55210 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP7P55210 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP7P55210 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP7P55210 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP7P55210 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP7P55210 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP7P55210 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP7P55210 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP7P55210 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP7P55210 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP7P55210 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP7P55210 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP7P55210 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP7P55210 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP7P55210 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP7P55210 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP7P55210 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASP7P55210 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASP7P55210 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASP7P55210 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASP7P55210 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP7P55210 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms