Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms