Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHBP55084 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHBP55084 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHBP55084 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHBP55084 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHBP55084 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHBP55084 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHBP55084 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHBP55084 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHBP55084 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHBP55084 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHBP55084 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHBP55084 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHBP55084 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HADHBP55084 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HADHBP55084 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HADHBP55084 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HADHBP55084 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHBP55084 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHBP55084 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms