Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms