Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLK1P49759 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLK1P49759 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLK1P49759 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLK1P49759 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLK1P49759 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLK1P49759 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms