Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNBP48739 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNBP48739 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms