Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCLCP48506 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCLCP48506 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLCP48506 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLCP48506 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLCP48506 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCLCP48506 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCLCP48506 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCLCP48506 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms