Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTGER2P43116 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGER2P43116 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGER2P43116 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGER2P43116 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGER2P43116 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms