Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAEP38570 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms