Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L1P36222 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms