Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPC1P35052 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms