Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC8A1P32418 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC8A1P32418 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms