Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPS1P31327 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPS1P31327 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPS1P31327 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPS1P31327 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPS1P31327 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CPS1P31327 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPS1P31327 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPS1P31327 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPS1P31327 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPS1P31327 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CPS1P31327 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CPS1P31327 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CPS1P31327 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPS1P31327 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPS1P31327 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPS1P31327 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPS1P31327 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPS1P31327 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPS1P31327 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPS1P31327 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPS1P31327 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPS1P31327 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CPS1P31327 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPS1P31327 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPS1P31327 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPS1P31327 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPS1P31327 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPS1P31327 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPS1P31327 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPS1P31327 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPS1P31327 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPS1P31327 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPS1P31327 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPS1P31327 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPS1P31327 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPS1P31327 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPS1P31327 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPS1P31327 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPS1P31327 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPS1P31327 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPS1P31327 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPS1P31327 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPS1P31327 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPS1P31327 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms