Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRBP28702 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRBP28702 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRBP28702 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRBP28702 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRBP28702 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRBP28702 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRBP28702 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRBP28702 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRBP28702 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRBP28702 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRBP28702 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRBP28702 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRBP28702 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRBP28702 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRBP28702 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRBP28702 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRBP28702 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRBP28702 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRBP28702 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms