Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms