Protein–RNA interactions for Protein: P21741

MDK, Midkine, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDKP21741 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDKP21741 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDKP21741 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDKP21741 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms