Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK11BP21127 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms