Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLP19338 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLP19338 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLP19338 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLP19338 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLP19338 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms