Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCC1P18754 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCC1P18754 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCC1P18754 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCC1P18754 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCC1P18754 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCC1P18754 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCC1P18754 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCC1P18754 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RCC1P18754 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RCC1P18754 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCC1P18754 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCC1P18754 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCC1P18754 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms