Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RARBP10826 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RARBP10826 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RARBP10826 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RARBP10826 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RARBP10826 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RARBP10826 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RARBP10826 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RARBP10826 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RARBP10826 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RARBP10826 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RARBP10826 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RARBP10826 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RARBP10826 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RARBP10826 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RARBP10826 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RARBP10826 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms