Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFMP07197 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFMP07197 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFMP07197 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFMP07197 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFMP07197 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFMP07197 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFMP07197 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFMP07197 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFMP07197 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFMP07197 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFMP07197 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFMP07197 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFMP07197 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFMP07197 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFMP07197 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFMP07197 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFMP07197 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms