Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR1AO95602 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms