Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN9O95484 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN9O95484 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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