Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP19O94966 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP19O94966 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP19O94966 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP19O94966 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP19O94966 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP19O94966 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP19O94966 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP19O94966 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP19O94966 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP19O94966 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP19O94966 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP19O94966 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP19O94966 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP19O94966 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP19O94966 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP19O94966 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP19O94966 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP19O94966 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP19O94966 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP19O94966 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP19O94966 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP19O94966 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP19O94966 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP19O94966 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP19O94966 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP19O94966 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP19O94966 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP19O94966 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP19O94966 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP19O94966 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP19O94966 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP19O94966 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP19O94966 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms