Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG13O75143 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG13O75143 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG13O75143 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG13O75143 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG13O75143 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG13O75143 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG13O75143 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG13O75143 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG13O75143 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG13O75143 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG13O75143 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG13O75143 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG13O75143 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG13O75143 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG13O75143 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG13O75143 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG13O75143 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG13O75143 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG13O75143 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG13O75143 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG13O75143 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG13O75143 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG13O75143 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG13O75143 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG13O75143 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG13O75143 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG13O75143 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG13O75143 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG13O75143 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG13O75143 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms