Protein–RNA interactions for Protein: O60840

CACNA1F, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, humanhuman

Predictions only

Length 1,977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1FO60840 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1FO60840 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms