Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSCO60682 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSCO60682 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSCO60682 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSCO60682 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSCO60682 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSCO60682 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSCO60682 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSCO60682 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSCO60682 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MSCO60682 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MSCO60682 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MSCO60682 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MSCO60682 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MSCO60682 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MSCO60682 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSCO60682 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSCO60682 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSCO60682 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms