Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN3BO60391 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms