Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAK2O60296 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms