Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRC1O43663 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRC1O43663 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRC1O43663 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRC1O43663 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRC1O43663 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRC1O43663 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRC1O43663 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRC1O43663 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRC1O43663 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRC1O43663 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRC1O43663 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRC1O43663 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRC1O43663 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRC1O43663 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRC1O43663 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRC1O43663 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRC1O43663 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRC1O43663 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRC1O43663 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRC1O43663 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRC1O43663 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRC1O43663 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRC1O43663 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRC1O43663 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRC1O43663 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRC1O43663 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRC1O43663 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRC1O43663 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRC1O43663 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRC1O43663 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRC1O43663 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRC1O43663 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRC1O43663 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms