Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms