Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS3O14543 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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