Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms