Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3C2AO00443 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3C2AO00443 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms