Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms